台灣長年缺乏國土規劃，導致台灣社會問題叢生，工廠違法散佈在農地，汙染難以有效控制，因此台灣農地污染情形特別嚴重，廠商卻又不需付出汙染代價，違法者得利益，守法者得汙染。每次大選前，違法業者就會透過各種管道放寬違章工廠的管制條件，形同趁火打劫。放寬違章工廠管制，讓廠商可以方便將農地地目變更，未來可能轉手圖利。對於守法設廠於工業區的廠商而言，本政策是一大諷刺，對台灣工業區經營管理也是負面的影響。但是馬政府選前綁樁大放送，大開違章工廠就地合法之門。11月24日下午，經濟部在立法院要求下召開公聽會，檢討開放政策，環保團體訴求如下：
先處理所有地下工廠，再談違章工廠就地合法
不在工業區集中處裡的汙染物質，成本相對高，因此貪圖農地便宜的違法廠商，更難付出超成本處理汙染，也導致工業區閒置問題。近年來台灣空氣汙染嚴重威脅人民健康，之前數起食安事件肇因，都源自地下工廠。經濟部一直以僅是讓符合工廠管理輔導法的廠商就地合法，但擺明宣示政府不作為，讓其他地下工廠存僥倖心態，繼續危害國人健康。
保障受汙染者知情與同意權
經濟部召開的公聽會，僅邀請廠商。真正受害者，是違章工廠附近的居民，完全沒有決定污染要不要留在我家隔壁的權利。因此環保團體主張，違章工廠就地合法，應召開社區公聽會，經過社區居民同意。
確保歸回原用生態用地、不得轉售、專租炒作
本次違章工廠就地合法爭議在於，可以快速變更農業用地。簡單的說，廠商汙染農地賺錢之後，可以不用負擔恢復原狀的成本，又可以變更成建地待價而沽。不只是汙染者得利，未來還可以炒地皮。環保團體呼籲經濟部應有嚴格規範，廠商停止使用之後，該地應回復作為生態用地，不得轉租、轉售、炒作。
生態與糧食補償措施
因為違法廠商節省到工業區設廠的成本，農地原本有糧食安全、生態效益、氣候變遷調適功能就消失殆盡。廠商長年已經謀得不當利得，若政府執意忽略糧食安全、國人健康與正規的工業管理讓它們就地合法。應該要求廠商負起生態與糧食補償責任。
聲明團體：台灣環保聯盟、台南社大環境小組、地球公民基金會、台灣水資源保育聯盟、蠻野心足生態協會、看守台灣協會。